Zentrum für Bioinformatik Hamburg

Forschungsschwerpunkte

• Abteilung für Genominformatik
  • Biologische Sequenzanalyse
  • Mustersuche in biologischen Sequenzen
  • Vergleich von Genomen (Modellierung metabolischer Pathways)
  • Genvorhersage (Auswertung von Genexpressionsdaten)
• Abteilung für Biomolekulare Modellierung
• Force field development for recognising proteins folds
• Mixing protein sequence comparison with structure-based methods
• Protein modelling applications
• Methods for protein & RNA design
• Simulation of ecosystems evolution
• Abteilung für Algorithmisches Molekulares Design
  • Molekulares Docking und molekulare Ähnlichkeit
  • Effizientes struktur- und ligandbasiertes Virtual Screening
  • Suche in kombinatorischen chemischen Räumen (Library Design)
  • Visualisierung beim molekularen Design
  • Informatik-Probleme beim computergestützten molekularen Design

Dienstleistungsangebot

• Forschung im Bereich Bioinformatik
• Aus- und Weiterbildung in Bioinformatik
• Beratung bei bioinformatischen Fragestellungen
• Veranstaltung von Vorträgen, Workshops und Tagungen zu bioinformatischen Themen

Kooperation mit der Praxis

• diverse Kooperationsprojekte im Themenumfeld Bio- und Chemoinformatik, insbesondere im Bereich computergestütztes Wirkstoffdesign. Unter anderem werden zur Zeit Projekte mit mehreren Firmen und Forschungseinrichtungen im Life-Science Umfeld durchgeführt

Zielgruppe / Kundenkreis

• Forschungseinrichtungen mit Interesse an bioinformatischen Fragestellungen
• Firmen mit thematischen Schwerpunkten in Lebenswissenschaften, Biotechnologie und Informatik im wissenschaftlichen Kontext

Publikationen

• Informationsbroschüre
  • http://www.zbh.uni-hamburg.de/studium/informationen-fuer-schueler-innen.html
• Jährliche Tätigkeitsberichte des Zentrums für Bioinformatik Hamburg, siehe
• http://www.zbh.uni-hamburg.de/documents.php
• Wissenschaftliche Publikationen:
  • http://www.zbh.uni-hamburg.de/forschung/gi/publikationen.html
  • http://www.zbh.uni-hamburg.de/forschung/bm/publikationen.html
  • http://www.zbh.uni-hamburg.de/forschung/amd/publikationen.html
  • http://www.zbh.uni-hamburg.de/forschung/tcc/publikationen.html
  • http://www.zbh.uni-hamburg.de/forschung/acm/publikationen.html

Geräteausstattung

• PC-Linux basierter Compute-Cluster
• PC-Linux basierter Rechnerpool
• diverse Workstations (SUN, SGI)
• diverse Software im Bereich Bioinformatik / Molecular Modelling

Ansprechpartner

Prof. Dr. Matthias Rarey
Bundesstraße 43
20146 Hamburg
Telefon: +49 40 42838-7350
Fax: +49 40 42838-7352
E-Mail: rarey"AT"zbh.uni-hamburg.de