UHH Newsletter

Oktober 2014, Nr. 67

FORSCHUNG



Kontakt:

Prof. Arwen Pearson
Projektleiterin
The Hamburg Centre for Ultrafast Imaging (CUI)

t. 040.8998-6650
e. Arwen.pearson"AT"cfel.de


Dr. Briony Yorke
Projektwissenschaftlerin
The Hamburg Centre for Ultrafast Imaging (CUI)

t. 040.8998-6655
e. briony.yorke"AT"cfel.de

Prof. Arwen Pearson hat einen Weg gefunden, Bewegungen biologischer Strukturen auf atomarer Ebene zu beobachten, ohne starke Strahlungsquellen zu nutzen. Foto: Provided by University of Leeds

Prof. Arwen Pearson hat einen Weg gefunden, Bewegungen biologischer Strukturen auf atomarer Ebene zu beobachten, ohne starke Strahlungsquellen zu nutzen. Foto: Provided by University of Leeds

Neues Verfahren zur Beobachtung von Molekülbewegungen

Kristallographie ermöglicht es, die Struktur von Molekülen zu analysieren. Im Fachmagazin „Nature Methods“ beschreibt ein Forschungsteam unter der Leitung von Prof. Arwen Pearson vom Hamburg Centre for Ultrafast Imaging (CUI) jetzt eine neue Art der sogenannten zeitaufgelösten Kristallographie. Diese Methode zur Beobachtung von Strukturänderungen in Molekülen erlaubt es einer deutlich größeren Zahl von Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftlern als bisher, Proteindynamik zu analysieren, also die Bewegungen von Proteinen, die deren Funktion bestimmen.

„Die Natur bewegt sich. Und um sie zu verstehen, müssen wir in der Lage sein, die Bewegungen biologischer Strukturen auf atomarer Ebene zu beobachten“, so Prof. Pearson, die an der University of Leeds geforscht hat, bevor sie im Mai an die Universität Hamburg zum Exzellenzcluster CUI wechselte. Das Verständnis atomarer Strukturveränderungen ist eine Voraussetzung für die Entwicklung neuer, nebenwirkungsfreier Medikamente und von intelligenten funktionellen Materialien der nächsten Generation.

Traditionelle Kristallographie liefert nur statische Bilder

Bei der traditionellen Kristallographie wird ein Kristall mit Röntgenstrahlen beschossen. Die Art, wie die Strahlen von den Atomen im Kristall gebrochen werden, lässt Rückschlüsse auf seine Struktur zu. Allerdings zeigt das gewonnene Beugungsbild nur den Durchschnitt aller Moleküle und ihrer Bewegungen in einem Kristall während der Zeitdauer des Experiments. Solch ein statisches Bild reicht nicht aus, um zu erforschen, wie molekulare Strukturen arbeiten; dafür benötigt man bewegte Bilder.

Gegenwärtig werden bewegte Bilder mit zeitaufgelöster Kristallographie erzeugt. Doch bei der bislang verwendeten Methode können die Schnappschüsse nur für einen sehr kurzen Moment sichtbar gemacht werden, um die Molekular-Bewegung einzufangen. Das bedeutet, dass nur ein außerordentlich kurzer Moment zur Verfügung steht, um mit Hilfe des Lichtpulses ein kristallographisches Bild zu erzeugen. Derzeit stellen weltweit überhaupt nur drei Synchrotrons – in den USA, in Frankreich und in Japan –, Strahlführungen mit der hierfür benötigten Auslegung zur Verfügung.

Neue Methode macht unabhängig von starken Strahlungsquellen

Die von Prof. Pearson entwickelte Methode basiert auf der mathematischen Methode der Hadamard Transformation, bei der Informationen anders dargestellt werden – so wie etwa Bildinformationen auf Negativen in Falschfarben erscheinen –, so dass deutlich weniger starke Strahlungsquellen erforderlich sind.

„Das Wunderbare an der Methode ist, dass wir keine scharfen Bilder und deswegen auch keine brillanten Strahlen benötigen“, sagt Arwen Pearson. Die durch die Hadamard Transformation definierten Pulse erzeugen ein einzelnes kristallographisches Bild wie ein sehr lang belichtetes Foto. Das Experiment wird mit einer Serie von Lichtpulsen wiederholt und erzeugt weitere „lang belichtete Fotos“. Zwar ist jedes einzelne dieser Fotos unscharf; aus den Unterschieden der einzelnen Bilder und der Lichtpuls-Formen ergibt sich aber die für einen Film nötige zeitaufgelöste Information.

Originalveröffentlichung:
Yorke, Beddard, Owen, and Pearson, “Time-resolved crystallography using the Hadamard Transform”, DOI: 10.1038/nmeth.3139

PM/Red.
 
 
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