Im Januar 2009 hat die Stadt Hamburg eine eigene Landesexzellenzinitiative ins Leben gerufen, um Hamburger Forschungsverbünde zielgerichtet zu fördern. Im Juni 2009 konnte die Joachim Herz Stiftung als Partner der Landesexzellenzinitiative gewonnen werden.

Die grundsätzlich interdisziplinär
ausgerichteten Vorhaben wurden für einen Zeitraum von 3,5 Jahren
geplant. Sie werden zunächst bis Ende 2010 von der
Landesexzellenzinitiative gefördert, anschließend soll bis 2012 eine
Finanzierung durch die Wissenschaftsstiftung erfolgen.
Für die Landesexzellenzinitiative hat die Freie und Hansestadt Hamburg Fördermittel im Umfang von 15 Mio. Euro für zwei Jahre zur Verfügung gestellt. Es ist geplant, weitere 20 Mio. Euro für zwei zusätzliche Jahre über die Forschungs- und Wissenschaftsstiftung Hamburg in die Förderung einfließen zu lassen. Darüber hinaus konnte die Joachim Herz Stiftung als privater Förderer und Partner für die Initiative gewonnen werden.